В консоли Configuration Manager перейдите в раздел System Center Configuration Manager / База данных сайта / Управление сайтом / <код сайта> - <имя сайта> / Параметры сайта / Адреса.

В области результатов щелкните правой кнопкой мыши адрес, который требуется удалить, и выберите команду Удалить.